Figure 4 of
Wistow, Mol Vis 2002;
8:171-184.Figure 4 of
Wistow, Mol Vis 2002;
8:171-184.
Figure 4. Lengsin is related to glutamine synthetases
Sequence comparison of human lengsin (LGS) with a prokaryotic glutamine synthetase superfamily member, the tdnQ protein of Pseudomonas putida (Pgs; GenBank accession number BAA12805). Identical residues are indicated. Sequences in red match PFAM profiles for glutamine synthetases (PF00120), as in Figure 3.
LGS: 82 KNRLQFVRFEATDLHGVSRSKTIPAHFFQEKVSHG--VCMPRGYLE----VIPNPKDNEM 135
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Pgs: 29 KAGLQMVRLSWPDQYGLLRGKMLSVAALRSAFASGSEITMAPFFFDTASAIVFNPFSADG 88
LGS: 136 NNIRATCFNS-DIVLMPELSTFRVLPWADRTARVICDTFTVTGEPLLTSPRYIAKRQLSH 194
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Pgs: 89 GLGSAELAGSPNVVMVPDPTTFRILPWADRTGWMLADLYMTSGRPFALSPRAILKKALVE 148
LGS: 195 LQASGFSLLSAF--------IYDFCI----FGVPEILNSKIISFPALT----FLNNH--- 235
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Pgs: 149 MQDLGYDYQAGLEVEWYLTRIVDPCLEPETLGGPGTPAAPPKVMPVAKGYSYLLENHLDE 208
LGS: 236 DQPFMQELVDGLYHTGANVESFSSSTRPGQMEISFLPEFGISSADNAFTLRTGVKEVARK 295
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Pgs: 209 VEPIMAEVRQHLLALGMPLRSIEDEWAPSQMETTFDVMPGLDVADTMVLFRNAVKQVCRR 268
LGS: 296 YNYIASFFIE---TGFCDSGI-LSHSLWDVDRKKNMFCSTSGTEQLTITGKKWLAGLLKH 351
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Pgs: 269 RGYLASFMCKPAIQGFLASGWHLHQSLTARDSGANAFIPQPG-EALSALGRSYVGGLLEH 327
LGS: 352 SAALSCLMAPSVSCRKRYSKDRKDLKKSVPTTWGYNDNSCIFN-IKCHGEKGTRIENKLG 410
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Pgs: 328 ACAASSFTTPTIN---GYRRRRPYSLAPDRVTWAKDNRAAMARVISAPGDPASRVENRIG 384
LGS: 411 SATANPYLVLAATVAAGLDGLHSSNEVLAGPDESTDFYQVEPSEIPLKLEDALVALEEDQ 470
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Pgs: 385 EPAANPYLYLASQVFSGIDGIR--RQLDPGPLQETP-YAGDVTILPHNLSEALEVLETSK 441
LGS: 471 CQRQALGETFIRYFVAMKKYE 491
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Pgs: 442 FFREAFGEEFIRYWMHLRRSE 462
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