Table 1 of Sundararajan, Mol Vis 2016; 22:401-423.


Table 1. In vitro study on Wistar rat lenses cultured for 24 h in Dulbecco’s modified Eagle’s medium: Primer sequences and expected product sizes for the genes amplified.

S. No. Name of the gene Primer sequence Size of the amplicon
1 m-calpain 5′ – ATCGCCTCCCTCACCTTGAAT– 3′
5′ –AGCTTTCAACCTCCTCGGCTCC– 3′ 411 bps
2 Lp82 5′ –GTGTTTCCGGCGGGCACCCA– 3′
5′ –CGCCGCCAATAATAAAGCGCG– 3′ 124 bps
3 EGR-1 5′ – CCTCCCATCACCTATACTGGCC – 3′
5′ – GGGGTTCAGGCCACAAAGTG– 3′ 76 bps
4 COX-1 5′ – TTCATCCGAGAAGTACTCATG – 3′
5′ – CTGGTGGGTGAAGTGTTGTGC – 3′ 306 bps
5 PMCA-1 5′ –TTGAGTGCTAATGGTGAGGCC– 3′
5′–GGCATATGGTTCTCAGGCCTT– 3′ 106 bps
6 NCX-1 5′–ATGGTCTACATGTTCCTCGGAG– 3′
5′–CCCAGGGCCATCAAGGTCAGG– 3′ 176 bps
7 SERCA-2 5′–GGTGAAGAAACGATTACAGCC– 3′
5′–TTCTATTGCATTTTCAGCGTT– 3′ 111 bps
8 Caspase-3 5′–GTTCATGTGTATGTTTTATAAG– 3′
5′–GTCCATGGAATTTAACCTCT– 3′ 432 bps
9 Caspase-8 5′ –GGATTTGAAATCTTTTAAGTT– 3′
5′ –GGCGAGTCCCACATGTCCTGCA– 3′ 297 bps
10 Caspase-9 5′ –GAGGTATTTTGGTAACCACG– 3
5′ –GTGGAGCATCCCATAAATGCA– 3 287 bps
11 GAPDH (internal control) 5′- TCAAGAAGGTGGTGAAGCAGGC −3′
5′- TTCAGTTACTCTCAAGAGCCA −3′ 207 bps