Table 1 of Han, Mol Vis 2011; 17:1381-1396.


Table 1. Primers used in cloning of xlProminin-1, 2 and 3 cDNAs.

Targets Sequences (5′-3′) Purpose
xlProminin-1 CGGGGTACCGTAGATCTCTTGGCATTCGCTAATG RT–PCR
  CGCGGATCCTTATGATAACCATTATTACCATTTTCCA RT–PCR
  ATTGACTGCTCCAGTGGCAC 5′RACE outer primer
  CATTAGCGAATGCCAAGAGATCTAC 5′RACE inner primer
  GTTTGGTTTGGGAGGAGCAACTGTG 3′RACE outer primer
  ATGGACACCGAAGATGTTTATGATG 3′RACE inner primer
xlProminin-2 CAGAAGGTCCAAGAGGAGTTTGC RT–PCR
  CCAGGGATTAGTTATATTGTCACACA RT–PCR
  ATTTGCATCGACTACAGCCTGC 5′RACE outer primer
  TTTTCAAGCACCAGGGGAAGGC 5′RACE inner primer
  TTGGAAAACCTGGCAACCGTGC 3′RACE outer primer
  AACTCCTTGGCTGAACTGGTCC 3′RACE inner primer
xlProminin-3 CATGTTGGCTGGAAATATCTGCATGTT RT–PCR
  TTGCCGAGATGTTGTCATCTCCAT RT–PCR
  TAGTAGCCACCAGGAGCTTAGC 5′RACE outer primer
  TCACGGCATTTACGGTGTTCAC 5′RACE inner primer
  AATTTTGCTCGCTGTGGACCAGTTGCCAGA 3′RACE outer primer
  TGCAAAGCACTACAGGAGGATGAAGACTTCT 3′RACE inner primer
Adaptor or anchor primers for RACE GGCCGCACGCGTCGACTAGTACGGGIIGGGIIGGGIIG 5′RACE adaptor primer
  GGCCGCACGCGTCGACTAGTAC 5′RACE anchor primer
  CGACTCACTATAGGGCGATTTTTTTTTTTTTTTTT 3′RACE adaptor primer
  CGGGGTACCGTAATACGACTCACTATAGGGCGA 3′RACE anchor primer