Table 1 of Fingert, Mol Vis 2010; 16:596-601.


Table 1. SNP genotyping results.

          p-values (allele frequency) p-values (genotype frequency)


Gene

SNP
ID

Location
(bp)

Spacing
(bp)
Minor
Allele
Frequency
NL versus
Steroid
Responders
NL
versus
POAG
NL versus
Steroid
Responders
NL
versus
POAG
SFRS3 rs7759778 36660245 10174 0.25 0.084 0.77 0.046 0.10
  rs1406945 36670419 7925 0.283 0.027 0.043 0.033 0.036
  rs7344 36678344 10783 0.217 0.11 0.11 0.011 0.073
  rs13202984 36689127   0.292 0.15 0.27 0.33 0.44
SFRS5 rs7153985 69296240 9254 0.117 0.13 0.59 0.36 0.17
  rs3104 69305494 4185 0.317 0.86 0.83 0.84 0.94
  rs8019166 69309679 3579 0.195 0.34 0.86 0.26 0.74
  rs4646296 69313258 4853 0.059 0.46 0.71 0.38 0.87
  rs17556915 69318111   0.175 0.30 0.41 0.37 0.64
SFRS9 rs2235222 119376576 3096 0.13333 0.37 0.94 0.53 0.60
  rs3847971 119379672 4985 0.35833 0.63 0.48 0.74 0.76
  rs9040 119384657 992 0.3 0.56 0.32 0.39 0.58
  rs7027 119385649 10520 0.15 0.27 0.14 0.68 0.37
  rs540520 119396169   0.28333 0.30 0.34 0.36 0.54
FKBP4 rs2968909 2768125 3706 0.15833 0.013 0.24 0.40 0.47
  rs3759411 2771831 6156 0.1 0.051 0.51 0.87 0.67
  rs1981655 2777987   0.05833 0.22 0.73 0.18 0.72
FKBP5 rs755658 35657648 12970 0.05833 0.17 0.83 0.35 0.92
  rs3798346 35670618 334 0.325 0.40 0.55 0.66 0.60
  rs9366890 35670952 4108 0.175 0.92 0.87 0.96 0.97
  rs9296158 35675060 2199 0.24167 0.56 0.55 0.56 0.59
  rs4713899 35677259 6206 0.15 0.92 >0.99 0.74 0.55
  rs737054 35683465 3515 0.225 0.26 0.68 0.24 0.26
  rs3777747 35686980 10068 0.43333 0.54 0.90 0.41 0.74
  rs9380524 35697048 28515 0.14167 0.23 0.24 0.46 0.46
  rs6912833 35725563 4336 0.24167 0.88 0.46 0.18 0.67
  rs17614642 35729899   0.13333 >0.99 >0.99 0.64 0.81
NR3C1 rs174048 142630597 4611 0.18333 0.30 0.19 0.40 0.26
  rs17287745 142635208 2006 0.39167 0.43 0.90 0.67 0.57
  rs17287758 142637214 12202 0.15833 0.91 0.79 0.44 0.45
  rs17209251 142649416 1085 0.20833 0.52 0.77 0.75 0.88
  rs10482672 142672726 4762 0.14167 0.59 0.60 0.51 0.62
  rs33388 142677488 26078 0.45833 0.76 0.42 0.68 0.39
  rs2918418 142703566 7003 0.175 0.41 0.15 0.64 0.37
  rs4912905 142710569 25628 0.23333 0.93 0.15 0.41 0.27
  rs2963155 142736197 11736 0.3 0.11 0.34 0.19 0.13
  rs9324921 142747933 13827 0.05833 0.72 0.35 0.88 0.39
  rs10482616 142761760 10917 0.125 0.67 0.54 0.53 0.57
  rs9324924 142772677 166 0.31667 0.52 0.11 0.75 0.18
  rs7701443 142772843 2075 0.29167 0.94 0.24 0.98 0.45
  rs4244032 142774918 1807 0.21667 0.70 0.44 0.76 0.51
  rs4607376 142776725 4948 0.45 0.19 >0.99 0.30 0.73
  rs13182800 142781673 4422 0.16667 0.70 0.76 0.80 0.79
  rs12054797 142786095 1130 0.24167 0.45 0.090 0.74 0.31
  rs12656106 142787225 1915 0.3 0.62 0.15 0.85 0.25
  rs12656106 142789140 8660 0.4833 0.82 0.67 0.96 0.89
  rs12521436 142797800 699 0.175 0.36 >0.99 0.29 0.97
  rs4912913 142798499   0.4833 0.94 >0.99 0.37 0.31